Selain angkutan penumpang, Bandara Hang Nadim juga melayani angkutan kargo (barang). Sejumlah maskapai penerbangan yang melayani transportasi kargo di Bandara Hang Nadim antara lain:

• Trigana,
• Tri MG,
• Pelita Air,
• Thai Lion,
• My INDO, dan
• White Sky.